A történet röviden
                                   (Szöveg: Wikipédia)  

A sorozat főhőse Uzumaki Naruto, egy fiatal fiú, akinek testében a rettegett kilencfarkú rókadémon raboskodik. Tizenkét évvel a történet kezdete előtt a róka megtámadta Avarrejtek nindzsák lakta faluját, és számos életet kioltott. A falu vezetője, a negyedik hokage saját életét feláldozva állította meg a bestiát, amit az újszülött Naruto testébe zárt. A fiút emiatt a falusiak kiközösítették, mintha csak ő maga lenne a rókadémon. A harmadik hokage, aki a negyedik hokage halála után újra a falu vezetője lett, megtiltotta, hogy bárki is beszéljen a róka támadásáról. Évekkel később, Narutót a renegát nindzsa, Mizuki becsapta, rávéve arra, hogy lopjon el egy tiltott tekercset. Ezek után Mizuki meg akarta ölni Narutót, hogy a tekercset elvéve saját céljaira használja azt. Naruto segítségére tanára, Umino Iruka érkezett. Amikor Iruka súlyos sérüléseket szerzett, hogy megvédje Narutót, diákja a tekercsről ellesett kage bunsin no dzsucut alkalmazta, amellyel legyőzte Mizukit. A dzsucu sikeres elsajátítására való tekintettel Iruka átengedte a Nindzsa Akadémia záróvizsgáján Narutót. A kaland során Naruto két dologra ébredt rá: az egyik, hogy a rókadémon benne lakozik; a másik pedig, hogy a hokagén kívül más is törődött vele.^[7]
A történet Naruto és barátai fejlődését követi nyomon, ahogyan nindzsa tudásukat fejlesztik, egymással való kapcsolatuk alakulását és azt, hogy múltjuk hogyan befolyásolja sorsukat és személyiségük fejlődését. Naruto két fiatal nindzsában, Uchiha Sasukében és Haruno Sakurában talál barátra és társra, mikor a 7-es Csapat nevű háromfős nindzsa csapatba kerül Hatake Kakasi felügyelete alá.^] Ahogyan az összes falu nindzsa csapatai, a 7-es csapat is teljesít küldetéseket. E kalandjaik során megismerik a környező falvakat és azok harcosait is. Egyre szorosabb szálak fűzik őket egymáshoz, képességekre és technikákra is szert tesznek, és szembesülnek a kamaszkor nehézségeivel és kihívásaival is, miközben Naruto az álmát követve azért küzd, hogy egyszer Avarrejtek hokagéja váljék belőle. Több küldetés teljesítése után Hatake Kakasi engedélyezi a 7-es csapat tagjainak, hogy részt vegyenek a nagy csúninvizsgán, melyen egy magasabb nindzsa rangot, a chunint szerezhetik meg, és így nehezebb küldetéseket vállalhatnak. A vizsga alatt Orochimaru, Avarrejtek egyik leghalálosabb ellenfele, megtámadja a falut és megöli a harmadik hokagét. A falu vezetőjének halála miatt Jiraija, a három legendás nindzsa egyike arra kényszerül, hogy felkutassa egykori csapattársát, Cunadét, hogy az betölthesse a megüresedett pozíciót. Útja során felfedezi, hogy Orocsimaru Ucsiha Szaszukéra is ki akarja vetni hálóját annak különleges genetikai öröksége miatt. Szaszuke, aki úgy hiszi, Orocsimaru meg tudja számára adni azt az erőt, amire szüksége van, hogy végezzen bátyjával, Uchiha Itachival, akit egy személyben tart felelősnek klánja lemészárlásáért, átpártol a falu esküdt ellenségéhez.  Cunade egy ötfős csapatot hoz létre Naruto részvételével, hogy Sasukét visszahozzák Avarrejtekbe. Naruto meg is küzd Sasukével, de nem képes legyőzni. Azonban még ezután sem hajlandó lemondani barátjáról, és két és fél éven át tartó edzésbe kezd Dzsiraija keze alatt, hogy felkészüljön következő találkozásukra. 

A két és fél éves edzés után Naruto hazaérkezik Avarrejtekbe. Ezzel közel egy időben feltűnik az Akatsuki nevű titokzatos bűnszervezet.Célja, hogy összegyűjtse mind a kilenc hatalmas erővel bíró farkas démont, köztük a Naruto testébe zárt kilencfarkú rókadémont is. Avarrejtek több nindzsája, köztük a 7-es Csapat is felveszi a harcot a szervezettel, és kísérletet tesznek Sasuke felkutatására is. Habár sikerül megmenteniük az Egyfarkú démon dzsincsúrikijét, Garát, az Akatsuki így is sikeresen elkap hét démont. Sasuke eközben elpártol Orochimarutól és szembeszáll Itachival. Bár összecsapásuk közben Itacsi életét veszti, Sasuke bosszúja mégsem teljesül be, mivel az Akatsuki egyik tagjától, Uchiha Madarától megtudja, hogy bátyját Avarrejtek vezetése utasította a klán kiirtására. A felismerés fájdalmától és haragtól vezérelve Sasuke összefog az Akatsukival, hogy elpusztítsa Avarrejteket. Mindeközben az Akatsuki több tagja is elesik az Avarrejtek nindzsáival vívott harcok során. A szervezet vezetője, Pain, megtámadja a falut azzal a céllal, hogy elrabolja Narutót. Terve nem sikerül, a Narutóval szembeni csatában alulmarad. Közben Cunade, mialatt megvédi a falusiakat Paintől, felhasználja minden erejét, kómába esik, ezért leváltják a hokage pozíciójából. A káoszban Danzó veszi át a hatalmat. Pain halála nem töri meg az Akatsukit, Ucsiha Madara Avarrejtekbe küldi Sasukét, aki végez Danzóval, Kisame pedig a Nyolcfarkú elfogását kapja feladatul. Közben megjelenik az Orochimaru képességeivel rendelkező Kabuto, aki szövetséget ajánl Madarának, s ereje fitogtatásául feltámasztja az Akatsuki megölt tagjait.

-------------------------------------------------
A szövegben előfordulló hibákért elnézést kérek igyekszem mihamarabb az összeset kijavítani. ( Hibák alatt a neveket pl: Akacuki, Szaszuke, Itacsi... lehet hogy valakit nem zavar de engem nagyon XD tehát mihamarabb kijavítom.